以下是南通理工学院招生信息网公布的各学院最新29个专业名单：
| 序号 | 专业名称 | 学制 | 序号 | 专业名称 | 学制 |
| 1 | 机械设计制造及其自动化 | 四年 | 16 | 船舶与海洋工程 | 四年 |
| 2 | 机械电子工程 | 四年 | 17 | 电气工程及其自动化 | 四年 |
| 3 | 金属材料工程 | 四年 | 18 | 自动化 | 四年 |
| 4 | 机器人工程 | 四年 | 19 | 电子信息工程 | 四年 |
| 5 | 汽车服务工程 | 四年 | 20 | 健康服务与管理 | 四年 |
| 6 | 车辆工程 | 四年 | 21 | 物流管理 | 四年 |
| 7 | 交通运输 | 四年 | 22 | 财务管理 | 四年 |
| 8 | 工程管理 | 四年 | 23 | 金融工程 | 四年 |
| 9 | 土木工程 | 四年 | 24 | 电子商务 | 四年 |
| 10 | 工程造价 | 四年 | 25 | 酒店管理 | 四年 |
| 11 | 软件工程 | 四年 | 26 | 市场营销 | 四年 |
| 12 | 数字媒体技术 | 四年 | 27 | 标准化工程 | 四年 |
| 13 | 计算机科学与技术 | 四年 | 28 | 环境设计（艺术类） | 四年 |
| 14 | 网络工程 | 四年 | 29 | 视觉传达设计（艺术类） | 四年 |
| 15 | 新能源科学与工程 | 四年 |
南通理工学院优势专业由南通理工学院历届学长学姐实名推荐：
1、 建筑工程技术 推荐指数: 4.6(39人推荐)
2、 道路桥梁工程技术 推荐指数: 4.7(27人推荐)
3、 船舶工程技术 推荐指数: 4.8(25人推荐)
4、 会计与审计 推荐指数: 4.3(20人推荐)
5、 新能源应用技术 推荐指数: 4.8(18人推荐)
6、 工程造价 推荐指数: 4.8(17人推荐)
7、 计算机网络技术 推荐指数: 4.6(11人推荐)
8、 生物技术及应用 推荐指数: 4.5(10人推荐)
9、 工程监理 推荐指数: 4.4(10人推荐)
10、 机电一体化技术 推荐指数: 5.0(9人推荐)
11、 会计 推荐指数: 4.4(9人推荐)
12、 电子信息工程技术 推荐指数: 4.7(8人推荐)
13、 建筑工程管理 推荐指数: 4.5(8人推荐)
14、 汽车检测与维修技术 推荐指数: 4.3(8人推荐)
15、 计算机应用技术 推荐指数: 4.3(8人推荐)
16、 港口物流设备与自动控制 推荐指数: 3.8(8人推荐)
17、 汽车制造与装配技术 推荐指数: 4.4(7人推荐)
