新疆农业大学科学技术学院2002年7月经自治区教育厅批准成立，2004年经国家教育部重新审批确认，为全国首批确认的124所（其中新疆2所）独立学院之一，是实施本科层次普通高等教育的独立学院。
学院现有农大东路校区（乌鲁木齐市沙区农大东路110号，占地84亩）和西山校区（乌鲁木齐市沙区西山新镇聚安路888号）。其中，西山校区坐落于西山大学城，距离乌鲁木齐市中心25公里，地处亚心腹地。西山校区建设项目于启动，总体规划面积1560亩，总建筑面积48万平方米；一期校园面积450亩，一期一步建筑面积10万平方米已于2017年9月投入使用；整体建成后可满足15000人办学规模需要。
文科专业：
| 人力资源管理 |
| 英语 |
| 物流管理 |
| 公共事业管理 |
| 中国少数民族语言文学 |
| 汉语言 |
| 国际经济与贸易 |
| 旅游管理 |
| 园林 |
理科专业：
| 水利水电工程 |
| 机械设计制造及其自动化 |
| 药学 |
| 中国少数民族语言文学 |
| 英语 |
| 生物技术 |
| 种子科学与工程 |
| 公共事业管理 |
| 农业电气化 |
| 物流管理 |
| 工程管理 |
| 电子信息科学与技术 |
| 食品科学与工程 |
| 计算机科学与技术 |
| 人力资源管理 |
| 旅游管理 |
| 国际经济与贸易 |
| 动物医学 |
| 动物科学 |
| 土地资源管理 |
| 经济学 |
| 汉语言 |
| 园林 |
| 序号 | 专业 | 学费标准 (元/牛/年） |
| 1 | 种子科学与工程 | 13000 |
| 2 | 中国少数民族语言文学 | 13000 |
| 3 | 园艺 | 13000 |
| 4 | 园林 | 14000 |
| 5 | 英语 | 14000 |
| 6 | 物流管理 | 14000 |
| 7 | 土木工程 | 15000 |
| 8 | 土地资源管理 | 14000 |
| 9 | 税收学 | 14000 |
| 10 | 水利水电工程 | 14000 |
| 11 | 生物技术 | 13000 |
| 12 | 审计学 | 14000 |
| 13 | 人力资源管理 | 14000 |
| 14 | 农业电气化 | 14000 |
| 15 | 旅游管理 | 14000 |
| 16 | 经济学 | 14000 |
| 17 | 计算机科学与技术 | 14000 |
| 18 | 汉语言 | 13000 |
| 19 | 俄语 | 13000 |
| 20 | 动物科学 | 13000 |
| 21 | 电子信息科学与技术 | 14000 |
