全国一共有43所开设生物工程专业的大学参与排名，其中排名第一的是浙江大学，排名第二的是四川大学，全部排名如下：
| 生物工程专业大学排名 | 大学名称 |
| 1 | 浙江大学 |
| 2 | 四川大学 |
| 3 | 上海交通大学 |
| 4 | 东南大学 |
| 5 | 西安交通大学 |
| 6 | 天津大学 |
| 7 | 清华大学 |
| 8 | 华中科技大学 |
| 9 | 南方医科大学 |
| 10 | 大连理工大学 |
| 11 | 复旦大学 |
| 12 | 重庆大学 |
| 13 | 同济大学 |
| 14 | 北京大学 |
| 15 | 中南大学 |
| 16 | 中国科学技术大学 |
| 17 | 电子科技大学 |
| 18 | 北京航空航天大学 |
| 19 | 北京工业大学 |
| 20 | 中国医科大学 |
| 21 | 山东大学 |
| 22 | 湖南大学 |
| 23 | 重庆医科大学 |
| 24 | 中山大学 |
| 25 | 天津医科大学 |
| 26 | 厦门大学 |
| 27 | 吉林大学 |
| 28 | 华南理工大学 |
| 29 | 暨南大学 |
| 30 | 首都医科大学 |
| 31 | 西安电子科技大学 |
| 32 | 南京理工大学 |
| 33 | 北京理工大学 |
| 34 | 西北工业大学 |
| 35 | 东北大学 |
| 36 | 燕山大学 |
| 37 | 华东理工大学 |
| 38 | 武汉大学 |
| 39 | 西南交通大学 |
| 40 | 河北工业大学 |
| 41 | 北京邮电大学 |
| 42 | 南京航空航天大学 |
| 43 | 南开大学 |
