重点高等院校，也称为重点高等学校、重点大学，是指国家立项重点支持、国家立项重点建设的高等院校、高等学校，1959年首批全国重点大学有北京大学等16所学校。
1959年5月17日，*为逐步提高教育质量，指定北京大学等16所学校为重点学校。此后，又分批增加若干所学校，进行重点高等院校建设。
1954年6所
1954年10月5日，中央《关于重点高等学校和专家工作范围的决议》指定6所学校为全国性重点大学：
北京大学、清华大学、中国人民大学、北京医学院、北京农业大学、哈尔滨工业大学。
1959年20所
1959年3月22日*发出《关于在高等学校中指定一批重点学校的决定》，指定16所高校为全国重点大学，试招研究生：
北京大学、清华大学、中国人民大学、复旦大学、中国科学技术大学、北京航空学院、北京农业大学、北京工业学院、北京医学院、北京师范大学、天津大学、哈尔滨工业大学、上海交通大学、华东师范大学、上海第一医学院、西安交通大学
同年8月又增加4所全国重点大学：中国人民解放军军事工程学院、中国人民解放军军事电信工程学院、中国协和医科大学、中国人民解放军第四军医大学。
1960年64所
1960年10月22中发（1960）868号 酉字《*关于增加全国重点高等学校的决定》，中央决定在原来20所（16+4）重点大学的基础上，再增加44所重点大学，原有的（校名前加☆的）和新增加的共64所：
1、综合大学13所
中国人民大学、北京大学、复旦大学、兰州大学、中国科学技术大学、吉林大学、南开大学、南京大学、武汉大学、中山大学、四川大学、山东大学、山东海洋学院（现中国海洋大学）。
南京大学
南京大学
2、工科院校32所
清华大学、哈尔滨工业大学、上海交通大学、西安交通大学、同济大学、北京航空学院（现北京航空航天大学）、华东纺织工学院（现东华大学）、华南工学院（现华南理工大学）、北京工业学院（现北京理工大学）、天津大学、大连工学院（现大连理工大学）、东北工学院（现东北大学）、南京工学院（现东南大学）、华中工学院（现华中科技大学）、成都电讯工程学院（现电子科技大学）、西北工业大学、合肥工业大学、北京石油学院（现中国石油大学（北京）、中国石油大学（华东））、北京地质学院（现中国地质大学（北京）、中国地质大学（武汉））、重庆大学、北京邮电学院（现北京邮电大学）、北京钢铁学院（现北京科技大学）、北京矿业学院（现中国矿业大学）、北京铁道学院（现北京交通大学）、北京化工学院（现北京化工大学）、唐山铁道学院（现西南交通大学）、吉林工业大学（并入吉林大学）、大连海运学院（现大连海事大学）、华东化工学院（现华东理工大学）、武汉水利电力学院（并入武汉大学）、中南矿冶学院（并入中南大学）、华东水利学院（现河海大学）。
华东理工大学
华东理工大学
3、师范院校2所
北京师范大学、华东师范大学。
4、农林院校3所
北京农业大学（并入中国农业大学）、北京农业机械化学院（并入中国农业大学）、北京林学院（现北京林业大学）
5、医学院校5所
中国协和医科大学、上海第一医学院（并入复旦大学）、北京医学院（并入北京大学）、北京中医学院（现北京中医药大学）、中山医学院（并入中山大学）
6、外语、政法院校4校
北京外国语学院（现北京外国语大学）、北京政法学院（现中国政法大学）、北京对外贸易学院（现对外经济贸易大学）、国际关系学院（1961年10月5日恢复原校名外交学院）。
南开大学
南开大学
7、音乐、体育院校2校
中央音乐学院、北京体育学院（现北京体育大学）
8、军事院校3所
中国人民解放军军事工程学院（现国防科技大学、哈尔滨工程大学、南京理工大学和若干军校）、第四军医大学、中国人民解放军军事电信工程学院（现西安电子科技大学）。
1963年4所
成都科学技术大学
成都科学技术大学
1963年9月12日教育部通知，增加3所全国重点高等学校：
厦门大学、浙江大学、上海外国语学院（现上海外国语大学）
1963年年底，南京农学院（现南京农业大学）被列为全国重点高校。
1964年1所
1964年，国际关系学院被列为全国重点高校。
至此，全国重点高校共69所。
1978年88所
中央“统一领导，分散管理”时期：1977年5月2日邓小平提出要办重点大学，集中优秀人才办。1978年2月17日，国务院转发教育部《关于恢复和办好全国重点高等学校的报告》，恢复文革前60所全国重点高等学校，并增加28所高校为重点大学，1978年国务院最终确定的88所全国重点大学至今仍具有重要影响力。
下列即是常说的1978年确定的88所全国重点大学（括号内为当今校名）按文件排序：
1、综合大学
教育部关于恢复和办好全国重点高等学校的报告
教育部关于恢复和办好全国重点高等学校的报告
双重领导，教育部为主（11所）：北京大学、复旦大学、吉林大学、南开大学、南京大学、武汉大学、中山大学、四川大学、山东大学、兰州大学、厦门大学
省、自治区领导（5所）：云南大学、西北大学、湘潭大学、新疆大学、内蒙古大学
2、理工科院校
双重领导，教育部为主（12所）：清华大学、西安交通大学、天津大学、大连工学院（现大连理工大学）、南京工学院（现东南大学）、华南工学院（现华南理工大学）、广东化工学院（现华南理工大学）、华中工学院（后更名华中理工大学，再与同济医科大学、武汉城市建设学院合并组建华中科技大学）、重庆大学、同济大学、上海化工学院（后复名华东化工学院，再更名华东理工大学）、浙江大学
双重领导，中国科学院为主（1所）：中国科学技术大学
双重领导，国防科委为主（1所）：长沙工学院（后更名国防科学技术大学，再更名国防科技大学）
双重领导，三机部为主（3所）：北京航空学院（现北京航空航天大学）、南京航空学院（现南京航空航天大学）、西北工业大学
双重领导，四机部为主（2所）：成都电讯工程学院（现电子科技大学）、西北电讯工程学院（现西安电子科技大学）
双重领导，五机部为主（2所）：北京工业学院（现北京理工大学）、华东工程学院（现南京理工大学）
双重领导，六机部为主（2所）：上海交通大学、哈尔滨船舶工程学院（现哈尔滨工程大学）
双重领导，八机总局为主（1所）：哈尔滨工业大学
双重领导，国家建委为主（1所）：重庆建筑工程学院（后与重庆大学、重庆建筑高等专科学校合并组建新的重庆大学）
双重领导，冶金部为主（3所）：北京钢铁学院（北京科技大学）、东北工学院（东北大学）、中南矿冶学院（后更名中南工业大学，再与湖南医科大学、长沙铁道学院合并组建中南大学）
双重领导，水电部为主（3所）：华东水利学院（现河海大学）、武汉水利电力学院（后更名武汉水利电力大学，再与武汉大学、武汉测绘科技大学、湖北医科大学合并组建新的武汉大学）、河北电力学院（现华北电力大学）
教育部关于恢复和办好全国重点高等学校的报告
教育部关于恢复和办好全国重点高等学校的报告
双重领导，石化部为主（3所）：华东石油学院（现中国石油大学（华东）、中国石油大学（北京））、北京化工学院（现北京化工大学）
大庆油田党委领导（1所）：大庆石油学院（现东北石油大学）
双重领导，煤炭部为主（2所）：四川矿业学院（现中国矿业大学、中国矿业大学（北京））、阜新煤矿学院（现辽宁工程技术大学）
双重领导，一机部为主（4所）：合肥工业大学、吉林工业大学（后与吉林大学、白求恩医科大学、长春科技大学、长春邮电学院合并组建新的吉林大学）、东北重型机械学院（现燕山大学）、镇江农业机械学院（后更名为江苏理工大学，再与镇江医学院和镇江师范专科学校合并组建江苏大学）
双重领导，交通部为主（1所）：大连海运学院（现大连海事大学）
双重领导，铁道部为主（2所）：北方交通大学（现北京交通大学）、西南交通大学
双重领导，纺织工业部为主（1所）：上海纺织工学院（后复名华东纺织工学院、更名中国纺织大学，再更名东华大学）
双重领导，轻工业部为主（1所）：西北轻工业学院（现陕西科技大学）。
双重领导，建材总局为主（1所）：武汉建筑材料工业学院（后更名武汉工业大学，再与武汉交通科技大学、武汉汽车工业大学合并组建武汉理工大学）
双重领导，地质总局为主（2所）：武汉地质学院（现中国地质大学（武汉）、中国地质大学（北京））、长春地质学院（后更名长春科技大学，再并入新组建的吉林大学）
双重领导，邮电部为主（1所）：北京邮电学院（现北京邮电大学）
双重领导，农林部为主（1所）：华北农业机械化学院（后复名北京农业机械化学院、更名北京农业工程大学，再与北京农业大学合并组建中国农业大学）
双重领导，中央气象局为主（1所）：南京气象学院（南京信息工程大学）
教育部关于恢复和办好全国重点高等学校的报告
教育部关于恢复和办好全国重点高等学校的报告
双重领导，测绘总局为主（1所）：武汉测绘学院（后更名武汉测绘科技大学，再并入组建新的武汉大学）
双重领导，国家海洋局为主（1所）：山东海洋学院（后更名青岛海洋大学，现中国海洋大学）
3、师范院校
双重领导，教育部为主（2所）：北京师范大学、上海师范大学（后复名华东师范大学）
4、农林院校
双重领导，农林部为主（1所）：华北农业大学（现中国农业大学）
双重领导，国家林业总局为主（1所）：云南林业学院（现北京林业大学）
省领导（2所）：江西共产主义劳动大学（现江西农业大学）、大寨农学院（现山西农业大学）
5、医药院校
卫生部直属（1所）：北京中医学院（现北京中医药大学）
双重领导，卫生部为主（4所）：北京医学院（后更名北京医科大学，再与北京大学合并组建新的北京大学）、上海第一医学院（后更名上海医科大学，再与复旦大学合并组建新的复旦大学）、中山医学院（后更名中山医科大学，再与中山大学合并组建新的中山大学）、四川医学院（后更名华西医科大学，再与四川大学合并组建新的四川大学）。
6、外语院校
教育部关于恢复和办好全国重点高等学校的报告
教育部关于恢复和办好全国重点高等学校的报告
外交部直属（1所）：北京外国语学院（现北京外国语大学）。.
双重领导，教育部为主（1所）：上海外国语学院（现上海外国语大学）
7、政法财经院校
双重领导，最高人民法院为主（1所）：西南政法学院（现西南政法大学）
双重领导，外贸部为主（1所）：北京对外贸易学院（现对外经济贸易大学）
8、艺术院校
文化部直属（1所）：中央音乐学院
9、体育院校
双重领导，国家体委为主（1所）：北京体育学院（现北京体育大学）
10、民族院校
双重领导，中央主管民族工作部门为主（1所）：中央民族学院（现中央民族大学）
注：之前68所重点高等学校中的数所高校没列入1978年年初恢复和办好的全国重点高等学校名单内。
1978年到1981年陆续追加（恢复）的全国重点高等学校：
国际关系学院（1978年9月，中央批准《调查部关于重建国际关系学院的报告》，仍为全国重点大学）
湖南大学（1978年8月，根据国务院国发27号文件，决定湖南大学改由第一机械工业部和湖南省双重领导，以一机部为主，并被列为全国重点高校）
成都科学技术大学（原名成都工学院；第一次全国科学大会后，中国科学院要来三所学校之一，另两所是浙江大学、黑龙江工学院。1978年10月划归中国科学院，更名为成都科学技术大学，成为全国重点大学；1980年10月改属原国家教委，1993年与四川大学合并成立四川联合大学，1998年更名为四川大学）
北京语言学院（1979年2月列入全国重点大学，今北京语言大学）
北京体育学院（1979年9月18日又列为全国重点高校，今北京体育大学）
中国人民大学（1978年7月7日，国务院恢复1971年4月撤消的中国人民大学，仍为全国重点大学）
中国首都医科大学（1979年7月31日，教育部下发《关于改变北京中医学院、中国首都医科大学领导体制的通知》，并列为全国重点大学；1985年改为中国协和医科大学，复名为北京协和医学院）
中国人民解放军第一军医大学（1979年被确定为全国重点大学，2004年改制更名为南方医科大学）
山西农业大学（1979年7月27日，国务院批准大寨农学院并入山西农学院，同年更名为山西农业大学，被列为全国重点高校）
南京农学院（1979年，江苏农学院恢复为南京农学院，又列为全国重点大学，1984年更名为南京农业大学）
西北农学院、西南农学院、沈阳农学院、华中农学院、华南农学院（1979年，教育部和农业部联合发布通知，这5所农业院校被国务院列为全国重点高校，经过合并、更名分别发展为西北农林科技大学、西南大学、沈阳农业大学、华中农业大学、华南农业大学）
上海第二医学院（1980年，教育部确定上海第二医学院为全国重点高校，由上海市领导；1985年更名为上海第二医科大学，2005年更名为上海交通大学医学院）
中国人民解放军铁道兵工程学院（1979年被列为全国重点高校，1984年1月1日更名为石家庄铁道学院，2010年更名为石家庄铁道大学）
改革开放初，中国共有99所全国重点大学（一说100余所，含第四军医大学、中国政法大学等文革前确定的重点大学）。经过合并调整，尚存91所。
注：“九五”期间，国家重点建设的高等学校为100所左右，中央政府并要求将此事当作面向“21世纪”的大事来抓。这项发展高等教育的重要措施开始简称为“211计划”，后来确定为“211工程”。原来的全国重点大学中，北京语言大学、国际关系学院、湘潭大学、燕山大学、西南政法大学、南京信息工程大学、江苏大学、东北石油大学、辽宁工程技术大学、陕西科技大学、华南农业大学、沈阳农业大学、山西农业大学、江西农业大学、北京协和医学院（2007年5月18日，与清华大学签订合作协议，北京协和医学院-清华大学医学部的学科建设由清华大学纳入“211工程”和“985工程”等国家重点建设工程的整体规划及其他相关计划之中，在政策和投入等方面给予重点支持。）等15所院校由于国家发展战略调整没有纳入国家“211工程”计划，仅存全国重点大学之名。
而原先不属于全国重点大学的上海财经大学、中央财经大学、中南财经政法大学、西南财经大学、东北师范大学、华中师范大学、陕西师范大学、南京师范大学、湖南师范大学、华南师范大学、东北林业大学、东北农业大学，江南大学、长安大学、中国传媒大学、第二军医大学、北京工业大学、上海大学、苏州大学、天津医科大学、河北工业大学、太原理工大学、郑州大学、辽宁大学、延边大学、安徽大学、福州大学、南昌大学、广西大学、四川农业大学、贵州大学、石河子大学、海南大学、西藏大学、宁夏大学、青海大学等36所院校由于部分自身行业特色或者国家重点大学的布局平衡、国家偏远地区政策照顾等原因，规划列入国家“211工程”计划，成为211大学，这些大学进入211工程的时间较晚。
