吉林医药学院1952年建校，前身为中国人民解放军第四军医大学吉林军医学院。2004年8月，学校由军队整体移交吉林省，成为省属公办高等学校，现为吉林省惟一独立设置的西医本科院校。2013年通过教育部本科教学工作合格评估，2017年通过教育部临床医学专业认证，有效期6年。学校现为吉林省硕士学位授权单位立项建设A类高校。
学校现有19个党政机关、3个群团组织、14个教学单位、5个教辅单位、1个省级科技协同创新中心；2所附属医院（第一临床医学院附属四六五医院、第二临床医学院附属梅河口市中心医院）和3所非直属附属医院（附属吉林省吉林中西医结合医院、附属吉林市人民医院、附属吉林油田总医院），均为三级甲等医院；各类实习实训基地163家。现有全日制在校生9923人，其中临床医学专业留学生352人。近三年，毕业生初次就业率保持在85%以上。
校本部教职工682人，专任教师455人（含聘用制），其中兼职博士研究生导师2人、硕士研究生导师45人，硕士及以上学位教师302人，高级职称200人。拥有新世纪百千万人才工程国家级人选1人、全国优秀科技工作者1人，享受国务院政府特殊津贴专家1人、教育部新世纪优秀人才支持计划人选1人、教育部高等学校教学指导委员会委员1人，现有吉林省人大代表1人、吉林省政协委员2人、长白山学者特聘教授１人，省拔尖创新人才7人（第一层次人选1人、第二层次人选1人）、省突出贡献中青年专业技术人才3人、省青年科技奖2人、省高校首批学科领军型教授1人，省教学名师5人、省教学新秀1人、省优秀教师1人。
现开设20个本科专业，6个专科专业，分布于医、理、工、管4个学科门类。现有国家级特色专业1个、省高水平特色专业A类2个、省级特色专业4个、省级品牌专业建设点2个、省级人才培养模式创新实验区3个、省级黄大年式教师团队1个、省级优秀教学团队9个、首批国家虚拟仿真实验教学项目1个、教育部产学合作协同育人项目1项、省级实验教学示范中心4个（建设单位2个）、国家精品资源共享课1门、国家级精品课程１门、国家精品在线开放课程1门、省级精品课程16门、省级精品在线开放课程6门（A类4门、B类2门）、省级“学科育人示范课程”２项；获吉林省教学成果奖一等奖2项。
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