为充分体现学生的自主性，渤海大学给学生提供五次申请转专业的机会。学生可以按照自己的兴趣和专长选择学习、研究方向，确立自己的职业目标。同时，学生还可以通过跨学科跨专业选修课程，达到一定学分之后，获得辅修第二专业的证明。
学生一入学，就可以自主选择研究型培养模式或适用型培养模式。在其后的发展过程中，两个类型之间在一定条件下可以相互转换或者调剂。无论选择哪种模式，学生都要学习相对固定的专业核心课和专业基础课。在确定两类基础课和核心课之后，选择研究型模式的学生可以根据本专业考研需求或者考研必须涉及的内容，再确定3到5门专业课，并且和外语、政治或者高数等课程组成新的选修课平台，供考研学生选修。选择适用型模式的学生在接下来的时间里进入开放选修课平台，其中的课程模块突出职业化特色。这个时期，跨学科跨专业选修课程已经开始，学生的选择十分自由。
渤海大学把学生在校学习时间分为四个阶段，第一阶段为通识教育阶段，重点在人文素养教育和专业兴趣教育，为学生后来的学习打下宽厚的基础。这一阶段，除了研究型平台的学生外，各专业之间的差别并不十分明显。第二阶段为专业教育阶段，通过这一阶段的学习，培养学生的专业意识和专业能力，为下一步延伸发展打下坚实的专业基础。第三阶段为开放教育（适用）阶段。所有的学生都将进入选修课方向平台，有能力的同学通过跨学科跨专业辅修第二专业获得相关证书或者重新调整知识或专业结构，为就业打下基础。第四阶段为专业实践阶段，在这一阶段，适用型的学生既可凭所选专业进入到专业实习和毕业实习，也可以凭第二辅修专业进行专业实习或毕业实习。
为实现个性化培养目的，渤海大学对考试考核方式进行改革，采取教考分离的办法，促进学生学习方式的转变。该校确定12个课程采取多课联考、案例考核、实践考核等灵活多样的考试、考核办法。对于实践性较强的课程，改用项目驱动的考核模式代替传统的笔试答题模式。在一些专业，学生还可以选择适合自己的课程考核方式，用自己完成的实际项目、大赛奖励、学术论文、专业认证等成果代替相关课程的考核。
