一、补充协议怎么写才有效，需要包括什么内容
1、原协议遗漏的事项进行补充。
例如，签订房屋租赁合同后，发现没有约定免租期，没有约定交房时间等问题。就这些问题可以重新签订一个补充协议进行约定。
2、原协议约定不明确需要补充明确。
例如，借款协议中约定，借款人应当向出借人支付利息，年利率不高于24%。这个约定就属于不明确，年利率10%不高于24%，年利率1%也不高于24%。这样如何支付利息就无法确定，这时候就可以重新签订一个补充协议对这个利率的问题予以明确。
3、修改、变更原协议的内容。
例如，签订了定制家具的合同后，客户发现准备定制的家具和自己家里的装修风格不搭，但是合同已经签订。这时候，只要双方同意，也可以就重新选定家具的风格做一个补充约定。
二、主合同与合同补充协议有冲突怎么办
以补充协议为准。因为补充协议可以视为合同双方主体对合同的变更协商一致了，不过这个新的约定一定要明确约定，不能模棱两可。补充协议中一般都会在尾部写明“原合同与本补充协议不一致的，以补充协议为准。”
值得注意的是，原合同明示不得变更的条款补充协议中对该条款发生的变更则不发生法律效力。
合同补充协议的拟定需要注意几个必备信息：一是双内方当事人的基本信息需全面具体;二是说明拟定补充协议的原因;三是协议补充的内容或变更的内容。
法律依据：
（1）、补充协议无效的五种情形 什么情况补充协议无效
合同无效五种情形解读如下：(1)以欺诈、胁迫手段订立合同，损害国家利益根据《民法通则若干问题的意见》第68条之规定，所谓欺诈是指一方当事人故意告知对方虚假情况，或者故意隐瞒真实情况，诱使对方当事人作出错误的意思表示。因欺诈而订立的合同，是在受欺诈人因欺诈行为发生错误认识而作意思表示的基础上产生的。你的原协议是怎么约定的？一般情况下我都写这么一条“本合同未尽事宜经双方协商一致签订补充协议，与本合同具...查看更多
（2）、劳动合同补充协议是否有法律效力
导语：劳动合同补充协议是在劳动合同签订后的进一步补充和修订，在实际生活中我们经常会遇到，特别是在劳动者和雇佣单位有利益冲突或者矛盾点，劳动合同中对此又没有相关的说明，签订一份劳动合同补充协议显得尤为必要了。那么劳动合同补充协议是否有法律效力呢? 劳动合同补充协议是否有法律效力双方自愿且符合劳动法要求前提下，签订的补充协议，与劳动合同享有同等法律效力。也就是说，一旦双方签字认同，如果出现违约情...查看更多
《合同法》第七十七条 当事人协商一致，可以变更合同。
法律、行政法规规定变更合同应当办理批准、登记等手续的，依照其规定。
补充协议签署在后，与主合同不一致，应视为双方对主合同的变更，因此应以权补充协议为准。
第七十八条 当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。
