新疆所有二本大学排名靠前的大学有：新疆财经大学、新疆师范大学、新疆医科大学、新疆农业大学、喀什大学、新疆工程学院、伊犁师范大学、塔里木大学等，具体名单见下表。
| 地区二本排名 | 全国二本排名 | 院校名称 | 层次 |
| 1 | 337 | 新疆财经大学 | 二本 |
| 2 | 353 | 新疆师范大学 | 二本 |
| 3 | 398 | 新疆医科大学 | 二本 |
| 4 | 417 | 新疆农业大学 | 二本 |
| 5 | 426 | 喀什大学 | 二本 |
| 6 | 441 | 新疆工程学院 | 二本 |
| 7 | 444 | 伊犁师范大学 | 二本 |
| 8 | 447 | 塔里木大学 | 二本 |
| 序号 | 学校名称 |
| 1 | 昌吉学院 |
| 2 | 喀什大学 |
| 3 | 塔里木大学 |
| 4 | 新疆财经大学 |
| 5 | 新疆第二医学院 |
| 6 | 新疆工程学院 |
| 7 | 新疆警察学院 |
| 8 | 新疆科技学院 |
| 9 | 新疆理工学院 |
| 10 | 新疆农业大学 |
| 11 | 新疆天山职业技术大学 |
| 12 | 新疆医科大学 |
| 13 | 新疆政法学院 |
| 14 | 伊犁师范大学 |
新疆农业大学：新疆农业大学在新疆是第二批次招生，所以我们通常说新疆农业大学是二本大学。新疆农业大学是新疆维吾尔自治区重点建设的一所以农业科学为优势和特色的公办大学。
新疆医科大学：新疆医科大学在各省招生批次本科一批和本科二批均有，没有明确一本或二本院校的定义。新疆医科大学是是新疆唯一一所独立建制的医学院校，为省部委共建高校、卓越医生教育培养计划项目试点高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、自治区首批来疆留学高校示范基地。
