南方科技大学居2016中国大学自然指数排行榜第55名
南方科技大学2016自然指数加权论文值（WFC）为13.88，居2016中国大学自然指数排行榜第55名（南方科技大学排名数据来源：艾瑞深中国校友会网2016中国大学自然指数排行榜）。
快车教育还发现，从全国范围内看：南方科技大学2016自然指数排名还领先于电子科技大学（中国一流大学/加权值：13.81/国内综合排名：37）、中国药科大学（中国高水平大学/加权值：13.76/国内综合排名：124）、国防科学技术大学（世界知名高水平大学/加权值：13.22/国内综合排名：9）、首都师范大学（中国知名大学/加权值：12.76/国内综合排名：92）、杭州师范大学（区域高水平大学/加权值：12.23/国内综合排名：185）等院校的排名。
从广东地域内的高校看：南方科技大学2016自然指数排名在暨南大学（中国高水平大学/加权值：11.23/国内综合排名：58）、华南师范大学（中国知名大学/加权值：11.09/国内综合排名：74）、深圳大学（中国高水平大学/加权值：7.85/国内综合排名：87）、汕头大学（中国知名大学/加权值：6.70/国内综合排名：123）、南方医科大学（中国高水平大学/加权值：5.99/国内综合排名：112）等院校之前。
此外，座落于广东的南方科技大学还是一所4星级的中国高水平大学，其2016的全国综合排名为第名。
