广东省共有43所二本批次招生的大学参与了2016广东二本大学排名，其中排名第一的是深圳大学，排名第二的是广东财经大学，排名第三的是广东金融学院。
以下是广东二本大学排名理科2016具体榜单，根据2015年理科二本录取平均分排名，包含部分专业在二本招生的一本大学。
| 广东二本大学排名 | 学校名称 | 录取平均分 |
| 1 | 深圳大学 | 584 |
| 2 | 广东财经大学 | 580 |
| 3 | 广东金融学院 | 574 |
| 4 | 广州美术学院 | 574 |
| 5 | 广东药学院 | 567 |
| 6 | 广东技术师范学院 | 564 |
| 7 | 广东医学院 | 562 |
| 8 | 东莞理工学院 | 559 |
| 9 | 仲恺农业工程学院 | 557 |
| 10 | 广东警官学院 | 556 |
| 11 | 五邑大学 | 553 |
| 12 | 广东第二师范学院 | 552 |
| 13 | 广东海洋大学 | 551 |
| 14 | 惠州学院 | 549 |
| 15 | 北京师范大学珠海分校 | 546 |
| 16 | 佛山科学技术学院 | 546 |
| 17 | 肇庆学院 | 542 |
| 18 | 广州航海学院 | 538 |
| 19 | 岭南师范学院 | 538 |
| 20 | 广州体育学院 | 537 |
| 21 | 韶关学院 | 535 |
| 22 | 嘉应学院 | 532 |
| 23 | 韩山师范学院 | 530 |
| 24 | 北京理工大学珠海学院 | 529 |
| 25 | 广东石油化工学院 | 529 |
| 26 | 吉林大学珠海学院 | 527 |
| 27 | 广东工业大学 | 520 |
| 28 | 广东外语外贸大学南国商学院 | 518 |
| 29 | 华南理工大学广州学院 | 516 |
| 30 | 电子科技大学中山学院 | 511 |
| 31 | 中山大学南方学院 | 510 |
| 32 | 广东工业大学华立学院 | 509 |
| 33 | 广东财经大学华商学院 | 507 |
| 34 | 中山大学新华学院 | 505 |
| 35 | 广东培正学院 | 501 |
| 36 | 广州大学华软软件学院 | 500 |
| 37 | 广州大学松田学院 | 500 |
| 38 | 东莞理工学院城市学院 | 498 |
| 39 | 广州商学院 | 497 |
| 40 | 广东白云学院 | 496 |
| 41 | 华南农业大学珠江学院 | 493 |
| 42 | 广东技术师范学院天河学院 | 492 |
| 43 | 广东东软学院 | 485 |
